56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_R0051 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_R0051  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000860706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0004  tRNA-Asp  93.59 
 
 		 78 bp  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155888  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0068  tRNA-Asp  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0006  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.217268  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0091  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000179456  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0043  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000153276  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0035  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000822611  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0013  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00001857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0086  tRNA-Asp  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0155365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0049  tRNA-Asp  91.49 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0598225  unclonable  6.706210000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0040  tRNA-Asp  94.87 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0028  tRNA-Asp  91.49 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000351463  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0047  tRNA-Asp  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.488675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0037  tRNA-Asp  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.897557 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0003  tRNA-Asp  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106798  normal  0.35233 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0036  tRNA-Asp  84.72 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000794884 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0012  tRNA-Asp  89.36 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000035701  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0052  tRNA-Asp  89.36 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000156743  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0050  tRNA-Asp  89.36 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0063  tRNA-Asp  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594649  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0052  tRNA-Asp  89.36 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000174221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0087  tRNA-Asp  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0054  tRNA-Asp  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000217975  normal  0.910624 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0046  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0045  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000116789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0043  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0031  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0057  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0074  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0057  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0077  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0112  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00279074  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0002  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0187578  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0046  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000106741  normal  0.144267 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t07  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.802625  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0064  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0066  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.319712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0051  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.681144  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0035  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000429398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0047  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0050  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0002  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0035  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000925215  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0047  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0050  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.989486  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0052  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0041  tRNA-Asp  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0134468  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0019  tRNA-Asp  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.4765400000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0054  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0057  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0671141  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0053  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0026  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>