More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2030 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2030  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 445 aa  902    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  55.58 
 
 		 457 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  53.76 
 
 		 443 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2810  glutamate--ammonia ligase  52.73 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000780353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  50 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  50.92 
 
 		 444 aa  443  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  50.45 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  48.87 
 
 		 444 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  49.31 
 
 		 443 aa  433  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  47.03 
 
 		 445 aa  431  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  49.77 
 
 		 444 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  48.63 
 
 		 445 aa  425  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  48.28 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  49.77 
 
 		 444 aa  425  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  48.86 
 
 		 442 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  46.1 
 
 		 442 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  45.6 
 
 		 441 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  48.08 
 
 		 443 aa  413  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  44.5 
 
 		 440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  46 
 
 		 444 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  45.48 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  45.77 
 
 		 444 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  45.25 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  45.25 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  45.25 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  45.25 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  45.25 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  45.25 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  44.82 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  44.82 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  45.25 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  45.31 
 
 		 444 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  45.77 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  43.76 
 
 		 444 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  44.12 
 
 		 443 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  46.17 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  44.29 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  40.51 
 
 		 445 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  43.02 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  43.02 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  42.79 
 
 		 446 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  42.47 
 
 		 456 aa  358  9e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  44.16 
 
 		 453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  44.65 
 
 		 452 aa  356  5e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  42.66 
 
 		 442 aa  355  1e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  40.05 
 
 		 447 aa  354  2e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  42.13 
 
 		 433 aa  352  5e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  42.14 
 
 		 448 aa  352  5.9999999999999994e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  42.02 
 
 		 442 aa  348  9e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  40.94 
 
 		 442 aa  344  2e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  41.89 
 
 		 456 aa  342  5.999999999999999e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  41.16 
 
 		 448 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  41.2 
 
 		 451 aa  341  1e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  38.8 
 
 		 447 aa  340  4e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  41.4 
 
 		 452 aa  339  7e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  41.99 
 
 		 447 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  39.95 
 
 		 442 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  41.61 
 
 		 448 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  40.61 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0202  L-glutamine synthetase  40.81 
 
 		 440 aa  333  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  42.31 
 
 		 451 aa  332  9e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  41.12 
 
 		 450 aa  330  3e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  40.09 
 
 		 439 aa  330  4e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  40 
 
 		 461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  39.45 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  41.95 
 
 		 451 aa  325  1e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  39.62 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  41.63 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  40.99 
 
 		 449 aa  323  3e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  40.42 
 
 		 446 aa  323  5e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  40.42 
 
 		 446 aa  323  6e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  39.5 
 
 		 450 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  40.37 
 
 		 443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  39.44 
 
 		 448 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  38.53 
 
 		 443 aa  319  5e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  39.41 
 
 		 446 aa  319  5e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  41.91 
 
 		 444 aa  319  6e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  38.6 
 
 		 449 aa  319  6e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  40.22 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  39.36 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  39.49 
 
 		 446 aa  316  6e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  38.3 
 
 		 446 aa  315  9e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  39.45 
 
 		 443 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  39.08 
 
 		 443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  38.43 
 
 		 447 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  37.14 
 
 		 443 aa  312  9e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  38.62 
 
 		 446 aa  311  1e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  40.18 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  39.27 
 
 		 447 aa  310  4e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  38.65 
 
 		 447 aa  309  5e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  36.81 
 
 		 450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  41.86 
 
 		 444 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2016  glutamine synthetase, type I  41.76 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  hitchhiker  0.0000000000000396297 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  37.08 
 
 		 448 aa  301  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  38.99 
 
 		 445 aa  300  3e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  37.44 
 
 		 439 aa  298  1e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  36.38 
 
 		 448 aa  298  2e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  36.64 
 
 		 439 aa  297  3e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  39.69 
 
 		 452 aa  296  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19880  L-glutamine synthetase  38.37 
 
 		 444 aa  295  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>