29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1562 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1562  heat domain-containing protein  100 
 
 
214 aa  428  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.882517  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2929  heat domain-containing protein  38.43 
 
 
217 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3322  hypothetical protein  39.11 
 
 
211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2196  heat domain-containing protein  35.35 
 
 
383 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1745  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.26 
 
 
221 aa  122  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00565425  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2272  hypothetical protein  43.78 
 
 
251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2517  hypothetical protein  34.22 
 
 
235 aa  112  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.40178  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2089  hypothetical protein  30.19 
 
 
334 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1597  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.66 
 
 
391 aa  95.9  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000656599  normal  0.759481 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0372  hypothetical protein  33.48 
 
 
237 aa  95.1  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3216  hypothetical protein  30.41 
 
 
229 aa  92.8  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0085  hypothetical protein  28.37 
 
 
376 aa  89  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.42821  hitchhiker  0.00374678 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0145  hypothetical protein  31.11 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2682  hypothetical protein  35.26 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1333  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  28.28 
 
 
391 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463199  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2086  hypothetical protein  32.77 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000175863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0137  hypothetical protein  25.27 
 
 
237 aa  59.3  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.357956 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.03 
 
 
1181 aa  49.7  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  27.45 
 
 
493 aa  46.6  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  45.16 
 
 
383 aa  46.2  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  26.56 
 
 
1094 aa  45.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  28.3 
 
 
546 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  28.98 
 
 
501 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.14 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  40 
 
 
831 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1313  hypothetical protein  30.25 
 
 
361 aa  43.5  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  29.08 
 
 
958 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0493  protein of unknown function DUF1730  33.82 
 
 
404 aa  42.4  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0126668 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.68 
 
 
667 aa  42.4  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>