18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3216 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3216  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0372  hypothetical protein  44.05 
 
 
237 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2272  hypothetical protein  46.85 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2517  hypothetical protein  39.64 
 
 
235 aa  156  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.40178  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2682  hypothetical protein  37.65 
 
 
260 aa  148  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2086  hypothetical protein  46.99 
 
 
186 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000175863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0137  hypothetical protein  37.08 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.357956 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0145  hypothetical protein  37 
 
 
230 aa  128  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3322  hypothetical protein  36.63 
 
 
211 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1745  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.04 
 
 
221 aa  95.9  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00565425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2929  heat domain-containing protein  33.87 
 
 
217 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1562  heat domain-containing protein  30.41 
 
 
214 aa  92.8  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.882517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1597  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.51 
 
 
391 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000656599  normal  0.759481 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2196  heat domain-containing protein  29.52 
 
 
383 aa  89.4  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1333  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  28.31 
 
 
391 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0085  hypothetical protein  24.48 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.42821  hitchhiker  0.00374678 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2089  hypothetical protein  25 
 
 
334 aa  55.5  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  30.69 
 
 
320 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>