21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2929 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2929  heat domain-containing protein  100 
 
 
217 aa  441  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1562  heat domain-containing protein  38.43 
 
 
214 aa  155  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.882517  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3322  hypothetical protein  39.91 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2089  hypothetical protein  31.6 
 
 
334 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2272  hypothetical protein  34.62 
 
 
251 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2517  hypothetical protein  28.69 
 
 
235 aa  95.5  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.40178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3216  hypothetical protein  33.87 
 
 
229 aa  95.1  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1597  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.54 
 
 
391 aa  94.7  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000656599  normal  0.759481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0085  hypothetical protein  28.5 
 
 
376 aa  95.1  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.42821  hitchhiker  0.00374678 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2196  heat domain-containing protein  31.13 
 
 
383 aa  90.1  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0372  hypothetical protein  32.07 
 
 
237 aa  88.6  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1745  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 
221 aa  88.6  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00565425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1333  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  30.38 
 
 
391 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463199  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0145  hypothetical protein  27.03 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2682  hypothetical protein  26.42 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0137  hypothetical protein  22.91 
 
 
237 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.357956 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2086  hypothetical protein  37.31 
 
 
186 aa  55.5  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000175863  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.14 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  29.5 
 
 
493 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  26.4 
 
 
1328 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.28 
 
 
1234 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>