15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2682 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2682  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  518  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2272  hypothetical protein  53.91 
 
 
251 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0145  hypothetical protein  50 
 
 
230 aa  215  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0372  hypothetical protein  58.92 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3216  hypothetical protein  37.65 
 
 
229 aa  148  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2517  hypothetical protein  45.95 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.40178  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0137  hypothetical protein  40.49 
 
 
237 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.357956 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2086  hypothetical protein  42.17 
 
 
186 aa  122  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000175863  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1562  heat domain-containing protein  35.26 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.882517  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3322  hypothetical protein  38.76 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2929  heat domain-containing protein  31.88 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1745  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.81 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00565425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1333  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  28.14 
 
 
391 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463199  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2196  heat domain-containing protein  26.87 
 
 
383 aa  46.2  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1597  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.26 
 
 
391 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000656599  normal  0.759481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>