27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3056 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3056  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  226  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.3077  normal  0.011343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1240  hypothetical protein  68.14 
 
 		 125 aa  167  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.370362  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0884  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  126  9.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0232  hypothetical protein  48.21 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.190765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  30.48 
 
 		 285 aa  67  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  31.37 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  27.88 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  33.93 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  30.84 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1336  hypothetical protein  23.81 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  24.24 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1548  hypothetical protein  25 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.466583  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3356  hypothetical protein  29.33 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  31.13 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3715  hypothetical protein  25.37 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  27.78 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2854  hypothetical protein  24.76 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3965  hypothetical protein  25.56 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0238816  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3627  hypothetical protein  25.56 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0256  hypothetical protein  30 
 
 		 127 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2981  hypothetical protein  25.96 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  30.19 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1008  hypothetical protein  25.96 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3331  hypothetical protein  25.96 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  31.78 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1041  hypothetical protein  25.96 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1029  hypothetical protein  25.96 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.674916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>