32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2536 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2536  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  100 
 
 		 271 aa  557  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.886692 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1597  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  72.49 
 
 		 284 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.92 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0920215  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5026  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.47 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5068  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.07 
 
 		 285 aa  198  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1657  hypothetical protein  44.14 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.76 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.454327 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4298  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.57 
 
 		 281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.232236 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1603  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.85 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4405  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.54 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6235  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.02 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.918479  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5191  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.8 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511652 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6523  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.3 
 
 		 272 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87249 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5595  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.17 
 
 		 275 aa  158  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2986  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.78 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.51 
 
 		 269 aa  122  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3234  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.6 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0540  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.27 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0042  ThiF family protein  25.09 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000190177 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0065  ThiF family protein  25.09 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.94015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0069  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.32 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.701248  normal  0.470884 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0100  hypothetical protein  25.09 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0405921  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0191  ThiF family protein  23.24 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02000  NEDD8 activating enzyme, putative  24.61 
 
 		 428 aa  50.4  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0777  thiamine biosynthesis protein ThiF  24.81 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.21058 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1633  thiamine biosynthesis protein ThiF  27.63 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1138  thiamine biosynthesis protein ThiF  27.97 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1858  thiF protein, putative  26.7 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33774  ubiquitin-activating enzyme E1, protein 3  26.46 
 
 		 462 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1158  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  26.72 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0720716  normal  0.0953853 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4371  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.67 
 
 		 367 aa  42  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.89161e-22 
 
 
-
 
NC_002950  PG0446  thiF protein  39.13 
 
 		 235 aa  42  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0750126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>