239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2032 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2032  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
251 aa  504  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.240988  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2309  pyridoxine 5'-phosphate synthase  84.27 
 
 
250 aa  427  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0100361  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.38 
 
 
240 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.75 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0109345  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4547  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.58 
 
 
240 aa  265  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  58.44 
 
 
243 aa  263  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09561  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.56 
 
 
245 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.361641 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1657  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.33 
 
 
249 aa  262  3e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3068  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.38 
 
 
243 aa  261  8e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.867372  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.97 
 
 
243 aa  259  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1192  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.61 
 
 
243 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1139  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.61 
 
 
243 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3614  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.61 
 
 
243 aa  259  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1414  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.51 
 
 
249 aa  259  4e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2526  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.56 
 
 
239 aa  258  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1207  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.97 
 
 
243 aa  258  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10801  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.32 
 
 
243 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.521124  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14741  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.91 
 
 
245 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.44969  normal  0.931321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  57.2 
 
 
243 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  57.2 
 
 
243 aa  256  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.2 
 
 
243 aa  256  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.2 
 
 
243 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4053  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.32 
 
 
235 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.539524  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.2 
 
 
243 aa  256  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4015  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.32 
 
 
235 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.2 
 
 
243 aa  256  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  57.2 
 
 
243 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1071  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  56.79 
 
 
243 aa  255  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.02 
 
 
248 aa  255  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.79 
 
 
243 aa  254  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0279  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.67 
 
 
243 aa  254  8e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0642  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.67 
 
 
245 aa  254  9e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.869515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.62 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1804  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.5 
 
 
239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.207619  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.38 
 
 
243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2729  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.1 
 
 
239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1350  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.02 
 
 
261 aa  252  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0751637  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.32 
 
 
243 aa  252  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.97 
 
 
243 aa  250  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1500  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  58.85 
 
 
241 aa  249  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.56 
 
 
243 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.56 
 
 
243 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.56 
 
 
243 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.56 
 
 
243 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0737  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.01 
 
 
248 aa  248  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548789  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.14 
 
 
243 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4746  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.62 
 
 
248 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314773  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1860  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.44 
 
 
243 aa  244  6.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.220115  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2083  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.72 
 
 
246 aa  243  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.301818  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0795  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.25 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.09 
 
 
242 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.498379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4119  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.67 
 
 
246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2367  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.09 
 
 
242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2455  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.09 
 
 
242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.55 
 
 
243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1385  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  53.91 
 
 
250 aa  243  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1002  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.56 
 
 
239 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148363  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1066  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.56 
 
 
263 aa  240  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0840275  normal  0.0462592 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.96 
 
 
243 aa  240  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1194  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.26 
 
 
265 aa  241  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1478  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.41 
 
 
248 aa  239  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323845  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11981  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.26 
 
 
238 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.526754  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.29 
 
 
247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.65 
 
 
245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2415  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.56 
 
 
260 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.82 
 
 
265 aa  238  5e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03404  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.65 
 
 
250 aa  238  9e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405613  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.61 
 
 
270 aa  237  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1600  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.47 
 
 
239 aa  237  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1885  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.44 
 
 
239 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000732794  hitchhiker  0.00000000475833 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12141  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.44 
 
 
323 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.224342  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12131  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.85 
 
 
238 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1436  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.48 
 
 
246 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532201  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1118  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.03 
 
 
238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0749349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.07 
 
 
239 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.44 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4177  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.85 
 
 
240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.44 
 
 
240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4285  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.07 
 
 
240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2242  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.91 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.626957  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4214  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  50.6 
 
 
246 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256384  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4371  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.87 
 
 
246 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.194442 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0975  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.21 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0997  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.61 
 
 
247 aa  232  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1076  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.45 
 
 
246 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.66 
 
 
240 aa  231  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1011  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.66 
 
 
240 aa  231  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1008  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.62 
 
 
248 aa  231  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3948  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.2 
 
 
246 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2333  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.03 
 
 
242 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0184  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.6 
 
 
248 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2257  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.22 
 
 
239 aa  229  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2522  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.07 
 
 
243 aa  229  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13808  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0643  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.23 
 
 
244 aa  229  5e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1246  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.6 
 
 
245 aa  228  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000778837  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1351  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.6 
 
 
245 aa  228  9e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0883  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.8 
 
 
245 aa  227  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.346326 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.17 
 
 
248 aa  227  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1204  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.2 
 
 
245 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0207409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1248  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.2 
 
 
245 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0135283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>