28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1517 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1517  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  158  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2593  hypothetical protein  78.49 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0540  hypothetical protein  56.82 
 
 		 93 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1511  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  55.21 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.144611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2731  hypothetical protein  54.65 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2991  pentapeptide MXKDX repeat protein  60.47 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272043  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  46.15 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  45.19 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3133  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  51.16 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal  0.206734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4332  hypothetical protein  45.68 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.834965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2530  hypothetical protein  43.53 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2814  pentapeptide MXKDX repeat protein  52.94 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0621  hypothetical protein  48.31 
 
 		 87 aa  50.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1200  pentapeptide MXKDX repeat protein  47.62 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.611594  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2570  pentapeptide MXKDX repeat protein  43.96 
 
 		 94 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2179  hypothetical protein  47.54 
 
 		 83 aa  47.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.565445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2931  hypothetical protein  64 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2538  hypothetical protein  62.5 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2843  hypothetical protein  48.75 
 
 		 169 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1196  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  47.13 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0762518  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1530  hypothetical protein  41.98 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1397  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  39.53 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1402  hypothetical protein  39.53 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386495  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0483  hypothetical protein  39.53 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0669  hypothetical protein  39.53 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.664868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1198  hypothetical protein  39.53 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0725407  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0866  pentapeptide MXKDX repeat protein  52.94 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4814  pentapeptide MXKDX repeat protein  39.53 
 
 		 82 aa  40  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.901496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>