252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5422 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5422  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  614  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1053  hypothetical protein  69.69 
 
 
288 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1300  hypothetical protein  68.79 
 
 
283 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0831  hypothetical protein  68.42 
 
 
287 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0522408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0902  hypothetical protein  68.07 
 
 
287 aa  391  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4338  hypothetical protein  66.67 
 
 
292 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0459562  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1653  hypothetical protein  64.6 
 
 
301 aa  381  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3603  hypothetical protein  69.58 
 
 
290 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.214493  hitchhiker  0.00628158 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0906  hypothetical protein  64.08 
 
 
285 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.960335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3336  hypothetical protein  59.86 
 
 
305 aa  345  5e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134312  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3490  hypothetical protein  54.74 
 
 
318 aa  312  4.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108033 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1915  hypothetical protein  52.7 
 
 
296 aa  295  8e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0081  hypothetical protein  51.23 
 
 
279 aa  290  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0322  hypothetical protein  51.76 
 
 
297 aa  288  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0350  hypothetical protein  51.55 
 
 
294 aa  288  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0070  hypothetical protein  49.47 
 
 
285 aa  287  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0577  hypothetical protein  51.76 
 
 
297 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0593  hypothetical protein  51.76 
 
 
297 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0482  hypothetical protein  51.41 
 
 
297 aa  285  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4126  hypothetical protein  50.53 
 
 
312 aa  285  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0403  hypothetical protein  49.66 
 
 
296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.7432  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3112  hypothetical protein  51.41 
 
 
297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0761  hypothetical protein  51.41 
 
 
297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0080  hypothetical protein  51.41 
 
 
297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1510  hypothetical protein  51.41 
 
 
297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.782325  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2938  hypothetical protein  51.41 
 
 
297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1620  hypothetical protein  50.84 
 
 
296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.623458  normal  0.975454 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0258  hypothetical protein  49.66 
 
 
297 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639918  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0592  hypothetical protein  50.35 
 
 
297 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178282  hitchhiker  0.00532801 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0520  hypothetical protein  51.41 
 
 
302 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0285  hypothetical protein  49.49 
 
 
297 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0145  hypothetical protein  50 
 
 
280 aa  280  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0297  hypothetical protein  50.85 
 
 
296 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0529  hypothetical protein  51.06 
 
 
278 aa  280  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.402264  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2181  hypothetical protein  51.06 
 
 
302 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0277901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2795  hypothetical protein  51.06 
 
 
302 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540439  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2806  hypothetical protein  51.06 
 
 
302 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.724657 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6125  hypothetical protein  50.35 
 
 
311 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.028257  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2855  hypothetical protein  50.35 
 
 
311 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.801383  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2713  hypothetical protein  50.35 
 
 
312 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0771  hypothetical protein  50 
 
 
299 aa  270  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0495801  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2797  hypothetical protein  49.83 
 
 
281 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2233  hypothetical protein  48.81 
 
 
288 aa  265  8.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2112  hypothetical protein  45.86 
 
 
286 aa  263  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002400  hypothetical ATP-binding protein UPF0042 contains P-loop  46.9 
 
 
287 aa  251  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3818  hypothetical protein  46.44 
 
 
284 aa  249  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.564753  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0495  hypothetical protein  45.7 
 
 
284 aa  248  7e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.159848  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4370  hypothetical protein  46.02 
 
 
284 aa  248  7e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.473818  normal  0.781233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3352  hypothetical protein  45.21 
 
 
284 aa  248  8e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00592419  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3660  hypothetical protein  45.76 
 
 
284 aa  248  9e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3964  hypothetical protein  45.36 
 
 
284 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0670  hypothetical protein  45.36 
 
 
284 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400157  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0669  hypothetical protein  45.36 
 
 
284 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  normal  0.167586 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3641  hypothetical protein  45.14 
 
 
284 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.564975  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0278  hypothetical protein  45.67 
 
 
285 aa  246  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.532116  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3682  hypothetical protein  45.14 
 
 
284 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0271  hypothetical protein  45.67 
 
 
285 aa  246  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3515  hypothetical protein  45.14 
 
 
284 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3513  hypothetical protein  45.14 
 
 
284 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3584  hypothetical protein  45.14 
 
 
284 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677427  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3620  hypothetical protein  45.14 
 
 
284 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.167343 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3021  ATPase  46.28 
 
 
299 aa  245  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2629  hypothetical protein  46.28 
 
 
299 aa  245  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.697513  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0571  hypothetical protein  44.33 
 
 
281 aa  244  9e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03070  hypothetical protein  45.1 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.776698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0502  conserved hypothetical protein  45.1 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3565  hypothetical protein  45.1 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3693  hypothetical protein  45.1 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3398  hypothetical protein  45.1 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03021  hypothetical protein  45.1 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3501  hypothetical protein  45.1 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0495  hypothetical protein  45.1 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.469234  normal  0.256599 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4527  hypothetical protein  45.1 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3314  hypothetical protein  44.76 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.304196  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0438  hypothetical protein  45.33 
 
 
284 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1156  hypothetical protein  45.33 
 
 
284 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0502  hypothetical protein  45.33 
 
 
284 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3091  hypothetical protein  43.64 
 
 
283 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.279163  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0712  hypothetical protein  44.03 
 
 
284 aa  240  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000213655  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4243  hypothetical protein  44.95 
 
 
280 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.220847  hitchhiker  0.000000309991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03196  hypothetical protein  45.02 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3671  hypothetical protein  44.37 
 
 
284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000686834  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0713  hypothetical protein  44.71 
 
 
284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0521342  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0704  hypothetical protein  44.37 
 
 
284 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.253725 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0683  hypothetical protein  44.37 
 
 
284 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0700496  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2130  hypothetical protein  45.73 
 
 
287 aa  239  5e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0723  hypothetical protein  43.05 
 
 
282 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.13975 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0739  hypothetical protein  44.29 
 
 
295 aa  235  7e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2229  hypothetical protein  44.9 
 
 
298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03667  hypothetical protein  45.55 
 
 
287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0667  hypothetical protein  43.4 
 
 
290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0854  hypothetical protein  44.29 
 
 
285 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0753  hypothetical protein  43.06 
 
 
290 aa  233  3e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.523032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2718  hypothetical protein  42.96 
 
 
294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0722  hypothetical protein  46.55 
 
 
286 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3147  hypothetical protein  42.52 
 
 
298 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3698  hypothetical protein  42.41 
 
 
293 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5683  hypothetical protein  41.72 
 
 
293 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5274  hypothetical protein  41.72 
 
 
293 aa  230  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.127118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5384  hypothetical protein  41.72 
 
 
293 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>