14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5061 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5061  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  340  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2053  hypothetical protein  45.88 
 
 		 151 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.327529  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2363  hypothetical protein  44.71 
 
 		 155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.641891  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2876  hypothetical protein  43.53 
 
 		 168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1385  hypothetical protein  43.2 
 
 		 182 aa  123  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.940229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4141  hypothetical protein  43.27 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  0.757742 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0486  hypothetical protein  41.18 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1817  hypothetical protein  44.19 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347413  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1455  hypothetical protein  26.42 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1337  putative proline-rich protein  26.11 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1402  hypothetical protein  28.3 
 
 		 178 aa  44.7  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0239807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1843  hypothetical protein  26.79 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1576  hypothetical protein  27.57 
 
 		 227 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4143  hypothetical protein  42.5 
 
 		 166 aa  41.2  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.0338226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>