26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3781 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3781  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  622  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185212  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2260  hypothetical protein  41.08 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1990  hypothetical protein  37.58 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0562007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  37.56 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1803  hypothetical protein  58.82 
 
 		 294 aa  92.4  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000895551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3043  putative cointegrate resolution protein  47.5 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  29.06 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  25.73 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  33.73 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  28.65 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  26.17 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1887  hypothetical protein  30.38 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  25.84 
 
 		 2196 aa  50.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  27.4 
 
 		 365 aa  49.7  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6604  hypothetical protein  36.04 
 
 		 343 aa  49.3  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6443  hypothetical protein  36.04 
 
 		 343 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3578  mucin-associated surface protein  43.59 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00254533  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5051  mucin-associated surface protein  44.44 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4307  hypothetical protein  35.14 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0184  hypothetical protein  33.71 
 
 		 346 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  hitchhiker  0.00509511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2650  Tn4652 cointegrate resolution protein T  28.32 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3239  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  27.17 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  34.52 
 
 		 350 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5161  mucin-associated surface protein  34.21 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0994  KfrAs  28.04 
 
 		 205 aa  42.7  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0971877  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3110  cointegrate resolution protein T  28.57 
 
 		 336 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00291993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>