43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2175 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2175  FeoA family protein  100 
 
 
113 aa  217  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599587  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1160  FeoA family protein  65.98 
 
 
105 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108627  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2435  FeoA family protein  68.75 
 
 
97 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1442  FeoA family protein  54.88 
 
 
116 aa  88.2  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.048364  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1470  transport protein A  61.54 
 
 
72 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.790576  normal  0.503496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47500  FeoA-like protein  41.67 
 
 
99 aa  60.1  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4062  FeoA family protein  56.86 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3949  FeoA family protein  56.86 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.572926 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5430  hypothetical protein  44.87 
 
 
105 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03714  hypothetical protein  56.86 
 
 
103 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.315414  normal  0.195727 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5891  Fe2+ transport system protein A  55.32 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1923  ferrous iron transport protein  53.06 
 
 
78 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.957635  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1861  FeoA family protein  53.06 
 
 
78 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1330  FeoA family protein  48.98 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0622  FeoA family protein  53.19 
 
 
81 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.459253 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00099  ferrous iron transport protein  57.45 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194888  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6109  putative FeoA family protein  48.33 
 
 
91 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0063  hypothetical protein  53.06 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.807854  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4040  FeoA family protein  51.67 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.100705 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1057  hypothetical protein  52.17 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0953  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5117  FeoA family protein  51.02 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2450  FeoA family protein  41.46 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2976  hypothetical protein  47.17 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.476434  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1803  FeoA family protein  43.75 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.960085  normal  0.141356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1110  hypothetical protein  45.45 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  51.72 
 
 
218 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0675  FeoA family protein  43.75 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0714  ferrous iron transport protein A  40 
 
 
85 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0624  ferrous iron transport protein A  40 
 
 
85 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0680  ferrous iron transport protein A  40 
 
 
85 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3543  FeoA family protein  36.59 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0769  putative ferrous iron transport protein A  40 
 
 
85 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000079809 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4588  putative ferrous iron transport protein A  40 
 
 
85 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0602  FeoA family protein  40 
 
 
85 aa  41.2  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0749  putative ferrous iron transport protein A  40 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0843  putative ferrous iron transport protein A  40 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.923464  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0874  FeoA family protein  33.82 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423206  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2850  hypothetical protein  38.75 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.921683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0624  ferrous iron transport protein A  40 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000493594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0783  ferrous iron transport protein A, putative  40 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0130272  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0896  FeoA family protein  33.82 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000698283  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0317  FeoA family protein  35 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585031  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>