21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1250 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1250  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1034  hypothetical protein  98.44 
 
 		 64 aa  124  5e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1062  hypothetical protein  90.62 
 
 		 64 aa  120  6e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6176  hypothetical protein  46.15 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2628  hypothetical protein  43.08 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0684  hypothetical protein  37.5 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.367344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  41.67 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2751  hypothetical protein  35 
 
 		 303 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0219  hypothetical protein  41.94 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  40.62 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1090  hypothetical protein  32.81 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  35.48 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1499  hypothetical protein  36.36 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  33.87 
 
 		 73 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1784  hypothetical protein  41.79 
 
 		 64 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.727128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  35 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0914  hypothetical protein  44.12 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0164503  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2197  hypothetical protein  37.88 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  37.1 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0621408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0981  hypothetical protein  37.1 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.995934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0269  putative transmembrane protein  31.75 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.514817  normal  0.593494 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>