42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0192 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  100 
 
 		 162 aa  308  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  92.59 
 
 		 162 aa  292  1e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  92.59 
 
 		 162 aa  290  6e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  29.41 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  28.83 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  26.8 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2211  Colicin V production protein  40.19 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  29.88 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  31.94 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  24.43 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2566  colicin V production protein  35.26 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2454  colicin V production family protein  26.14 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  32.71 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  35.45 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  30.67 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  28.68 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  30.15 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  26.92 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1283  colicin V production protein  30.06 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.797864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  28.97 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  29.03 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  28.04 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1015  Colicin V production protein  34.65 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1644  CvpA family protein  31.58 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  28.04 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0935  colicin V production protein  33.02 
 
 		 183 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4049  colicin V production protein  31.09 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.868969  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1266  colicin V production protein  32 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.488094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  33.96 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  33.94 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0823  hypothetical protein  26.79 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  30 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  29.75 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  25.2 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  25.2 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  25.64 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3696  Colicin V production protein  35.78 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  27.1 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3791  Colicin V production protein  33.94 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  24.6 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  26.17 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  27.68 
 
 		 165 aa  40.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>