28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2190 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2190  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  328  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2142  hypothetical protein  98.73 
 
 
158 aa  325  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0934  hypothetical protein  34 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3997  hypothetical protein  42.74 
 
 
161 aa  90.9  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2245  hypothetical protein  36.44 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.472151 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0940  hypothetical protein  33.9 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0606896  hitchhiker  0.00778912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2520  hypothetical protein  35.4 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2202  conserved hypothetical protein; putative secreted protein  34.48 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05688  hypothetical protein  32 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000073  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5640  hypothetical protein  33.05 
 
 
177 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00146587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2359  hypothetical protein  31.82 
 
 
181 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0847029  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3735  hypothetical protein  29.09 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  0.0462573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4456  hypothetical protein  29.51 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3971  hypothetical protein  33.61 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0383  hypothetical protein  30.08 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2903  hypothetical protein  27.05 
 
 
134 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.203392  normal  0.153041 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3369  hypothetical protein  26.02 
 
 
165 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.867444  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0415  hypothetical protein  28 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0438215  hitchhiker  0.000233911 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0919  hypothetical protein  46.81 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.404023  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2001  hypothetical protein  28.15 
 
 
183 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0724  hypothetical protein  27.56 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.108952  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1905  hypothetical protein  28.15 
 
 
183 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.539779 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1867  hypothetical protein  31.45 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3682  hypothetical protein  25.19 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.840145  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3299  hypothetical protein  27.78 
 
 
183 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.43455 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1032  hypothetical protein  26.05 
 
 
144 aa  42  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2396  hypothetical protein  27.78 
 
 
193 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>