17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5159 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5159  type 4 prepilin-like protein  100 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.259971  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1601  type 4 pilin  33.96 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3385  type IV pilin protein, putative  34.44 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0372  type 4 prepilin-like protein  32.1 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1711  type 4 prepilin-like protein  30.38 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1736  hypothetical protein  30.38 
 
 		 171 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0271  hypothetical protein  23.86 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2479  pilin-like protein  30.06 
 
 		 188 aa  47.8  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209449  hitchhiker  0.0000256314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  30.3 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4116  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  25.16 
 
 		 203 aa  45.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0233722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1863  hypothetical protein  23.73 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5000  hypothetical protein  23.53 
 
 		 215 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2905  Tfp pilus assembly protein FimT  26.62 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  28.38 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2590  pilin-like protein-like  28.48 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.545428 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  32.86 
 
 		 147 aa  41.6  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.58 
 
 		 194 aa  41.2  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>