23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4303 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4303  PRC-barrel domain protein  100 
 
 
329 aa  656    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  0.314708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4688  PRC-barrel  50.74 
 
 
325 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0745  PRC-barrel domain-containing protein  50.58 
 
 
329 aa  286  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4138  PRC-barrel domain protein  48.05 
 
 
318 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.359242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4099  PRC-barrel domain protein  48.05 
 
 
315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0357  PRC-barrel domain protein  45.4 
 
 
319 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1550  PRC-barrel  43.24 
 
 
378 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432457  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2044  hypothetical protein  40.53 
 
 
337 aa  206  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.774361  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2256  hypothetical protein  39.87 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0424  hypothetical protein  45.45 
 
 
360 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.668376  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03251  hypothetical protein  46.12 
 
 
369 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0060  hypothetical protein  46.6 
 
 
349 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00691  hypothetical protein  46.38 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00701  hypothetical protein  46.38 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.273319  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01221  hypothetical protein  44.29 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1421  PRC-barrel domain-containing protein  44.29 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00671  hypothetical protein  44.93 
 
 
339 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00661  hypothetical protein  41.82 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.693612  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0002  hypothetical protein  27.72 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.106351  normal  0.0651956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0077  hypothetical protein  27.61 
 
 
220 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0532  hypothetical protein  25.29 
 
 
286 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.38672  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0398  hypothetical protein  24.38 
 
 
349 aa  46.6  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0207  hypothetical protein  26.35 
 
 
248 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>