20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3715 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3715  glutaredoxin 2  100 
 
 
87 aa  180  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0820136  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1148  glutaredoxin 2  63.1 
 
 
95 aa  110  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4094  glutaredoxin 2  60.24 
 
 
87 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4152  glutaredoxin 2  61.8 
 
 
91 aa  104  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.128029  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4204  glutaredoxin 2  59.52 
 
 
95 aa  100  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4220  glutaredoxin 2  61.45 
 
 
84 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4055  glutaredoxin 2  56.63 
 
 
87 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1485  hypothetical protein  48.84 
 
 
88 aa  94.7  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04101  thioredoxin family protein  37.36 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.462862  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1588  ribonucleotide reductase (class II)  39.33 
 
 
88 aa  51.2  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  44.64 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21141  thioredoxin family protein  37.36 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04311  thioredoxin family protein  31.18 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.71994  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04631  thioredoxin family protein  36.96 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1746  thioredoxin family protein  35.16 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0789  ribonucleotide reductase (class II)  34.83 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318571  normal  0.0248071 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27670  predicted protein  32.47 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35557  predicted protein  37.5 
 
 
158 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.356085  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  36.36 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1466  hypothetical protein  36.54 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.57106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>