14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5586 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5586  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
118 aa  243  8e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4443  hypothetical protein  53.1 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253642  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5664  protein of unknown function DUF1486  53.45 
 
 
257 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  35.19 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2441  hypothetical protein  34.15 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114444  hitchhiker  0.00401231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1992  hypothetical protein  30.25 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209953  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  30.58 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  33.64 
 
 
128 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  36 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0684  putative taurine dehydrogenase, small subunit  29.75 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  34.48 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  31.03 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  30.69 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4515  hypothetical protein  29.09 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.275606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>