47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1772 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1772  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  709    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168486  normal  0.929714 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3102  hypothetical protein  50.42 
 
 
356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1210  hypothetical protein  50 
 
 
365 aa  316  4e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509053  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0750  hypothetical protein  50.14 
 
 
347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.942916  normal  0.298499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2256  hypothetical protein  51.58 
 
 
354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1367  hypothetical protein  46.29 
 
 
348 aa  287  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1321  hypothetical protein  47.83 
 
 
347 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5011  N-acylamino acid racemase  28.04 
 
 
368 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4992  N-acylamino acid racemase  26.82 
 
 
368 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4584  enolase superfamily protein; N-acylamino acid racemase, mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, or o-succinylbenzoate synthase  26.01 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4746  N-acylamino acid racemase  25.59 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5107  N-acylamino acid racemase  25.59 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4606  N-acylamino acid racemase; O-succinylbenzoate synthase  27.85 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4964  N-acylamino acid racemase  26.01 
 
 
368 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0256  N-acylamino acid racemase  26.69 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0874695  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.4 
 
 
368 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.01 
 
 
368 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4981  N-acylamino acid racemase  25.83 
 
 
368 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.66 
 
 
370 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.76 
 
 
368 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.165898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6166  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.53 
 
 
371 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2859  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.79 
 
 
370 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2106  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.23 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2799  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.25 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.22 
 
 
370 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1716  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.56 
 
 
375 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2532  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.35 
 
 
370 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0263  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.38 
 
 
370 aa  53.5  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.161308  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2677  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.99 
 
 
326 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.594823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2904  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.5 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.099364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1741  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.9 
 
 
370 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0655  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.32 
 
 
377 aa  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2438  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.11 
 
 
370 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.502974  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0826  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.07 
 
 
371 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1357  O-succinylbenzoic acid synthetase, putative  27.93 
 
 
333 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190133  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1882  o-succinylbenzoic acid synthetase  27.93 
 
 
333 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1846  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  27.93 
 
 
333 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.85 
 
 
368 aa  50.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1827  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  24.4 
 
 
372 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.84 
 
 
369 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.5 
 
 
380 aa  46.2  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3832  o-succinylbenzoate synthase  39.68 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4363  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.87 
 
 
377 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0404  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.76 
 
 
377 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.125828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0985  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.36 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2187  O-succinylbenzoate synthase  22.92 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1018  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.93 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>