85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2633 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2633  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  733    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3089  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.38 
 
 		 363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000960338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.14 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0594  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.37 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1050  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.2 
 
 		 649 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.4901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0639  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.22 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.143163  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0568  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.61 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000504659  normal  0.286887 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1771  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30 
 
 		 640 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.037293  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0215  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.25 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.750083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0911  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.51 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.159559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0015  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  26.42 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2301  peptidylprolyl isomerase  28.4 
 
 		 283 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1861  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.62 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1620  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.822074 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2359  peptidylprolyl isomerase  27.81 
 
 		 283 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0163258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1416  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.53 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.146032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3023  peptidylprolyl isomerase  27.81 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0966  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.17 
 
 		 359 aa  54.7  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000363046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0216  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.75 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000196807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0199  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.74 
 
 		 317 aa  53.9  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000517343 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2178  peptidylprolyl isomerase  27.33 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0828286  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2357  peptidylprolyl isomerase  27.33 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2115  peptidylprolyl isomerase  27.33 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000762926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2336  peptidylprolyl isomerase  27.33 
 
 		 298 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3165  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.39 
 
 		 382 aa  53.1  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.106005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2101  peptidylprolyl isomerase  26.63 
 
 		 283 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2436  peptidylprolyl isomerase  27.33 
 
 		 283 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3115  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.08 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0555  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.41 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000887936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3589  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.48 
 
 		 321 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000412854  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1733  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.74 
 
 		 642 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.345008  normal  0.064415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2144  peptidylprolyl isomerase  30.77 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0533  peptidyl-prolyl cis-trans isomerse D  34.25 
 
 		 605 aa  50.8  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0351  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.95 
 
 		 463 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0361  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  29.87 
 
 		 297 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00808135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1701  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.52 
 
 		 355 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000674315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3000  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.57 
 
 		 310 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.730656  normal  0.0111682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2432  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.21 
 
 		 299 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0014  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.38 
 
 		 440 aa  49.7  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000051018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1333  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.9 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.643924  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1906  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.4 
 
 		 623 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279691  hitchhiker  0.000032833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3465  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.22 
 
 		 623 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.797008  hitchhiker  0.00047703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0142  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.92 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2048  tRNA pseudouridine synthase  33.33 
 
 		 264 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.970717  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0035  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.3 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4335  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.63 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16734  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3132  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.41 
 
 		 627 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000394697  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3780  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D  33.81 
 
 		 638 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2304  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.21 
 
 		 623 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036882 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1460  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.81 
 
 		 281 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02087  Periplasmic parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  26.11 
 
 		 565 aa  47.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0160  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.29 
 
 		 632 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.981021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3549  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.22 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000983589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2280  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.14 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2368  peptidylprolyl isomerase  25.32 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0643  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.17 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221486  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2499  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.28 
 
 		 457 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.818045 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004040  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase PpiD  24.75 
 
 		 619 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000192385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2875  peptidylprolyl isomerase  24.89 
 
 		 280 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1413  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.99 
 
 		 626 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000608147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0203  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.08 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.701939 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0015  SurA domain  23.6 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00201021  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3022  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.11 
 
 		 630 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1920  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 		 259 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0828208  normal  0.871832 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1715  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase transmembrane protein  26.76 
 
 		 648 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0289129  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0767  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.91 
 
 		 304 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00516189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0809  peptidylprolyl isomerase  28.45 
 
 		 282 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126542  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2074  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  27.37 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0698  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.37 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000883424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3100  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.29 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2696  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.78 
 
 		 643 aa  43.9  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.508218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4481  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.28 
 
 		 323 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.117985 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1021  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.66 
 
 		 427 aa  43.5  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0740  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.44 
 
 		 345 aa  43.9  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1746  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.13 
 
 		 623 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000063552 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0253  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  26.88 
 
 		 248 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2880  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.68 
 
 		 631 aa  43.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1545  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.19 
 
 		 621 aa  43.1  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000368753  hitchhiker  0.00157323 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21140  peptidil-prolyl cis-trans isomerase  23.4 
 
 		 332 aa  43.1  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4490  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.63 
 
 		 338 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3722  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D, putative  26.62 
 
 		 627 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76996  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0489  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.3 
 
 		 455 aa  42.7  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4471  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.63 
 
 		 336 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0736  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.98 
 
 		 311 aa  42.7  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0918  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.92 
 
 		 435 aa  42.7  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00205446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>