More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0681 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0523  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  73.69 
 
 
498 aa  764    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0931485 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2665  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.73 
 
 
504 aa  686    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06740  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.27 
 
 
506 aa  686    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.725577  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01810  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.61 
 
 
505 aa  692    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139734 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0834  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65.26 
 
 
507 aa  654    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00885026  hitchhiker  0.000156856 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0407  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.81 
 
 
506 aa  728    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0111575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
497 aa  1019    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000239611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3214  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.27 
 
 
503 aa  724    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000978494  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0394  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.29 
 
 
500 aa  768    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.43 
 
 
485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.18 
 
 
508 aa  280  4e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.68 
 
 
488 aa  278  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.97 
 
 
504 aa  276  5e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.55 
 
 
482 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.55 
 
 
482 aa  273  6e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.91 
 
 
483 aa  271  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.08 
 
 
497 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.16 
 
 
483 aa  269  7e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.94 
 
 
487 aa  268  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.19 
 
 
504 aa  268  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.44 
 
 
503 aa  266  5.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  37.86 
 
 
484 aa  266  7e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.31 
 
 
507 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.89 
 
 
486 aa  263  4.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1556  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.22 
 
 
486 aa  261  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.1 
 
 
492 aa  261  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0948  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.14 
 
 
486 aa  260  3e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3370  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.79 
 
 
489 aa  256  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.88 
 
 
485 aa  256  8e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.17 
 
 
485 aa  256  8e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2646  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.68 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1488  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.08 
 
 
497 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.6 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0548  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.29 
 
 
547 aa  255  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.37 
 
 
488 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.34 
 
 
492 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1234  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.27 
 
 
488 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.6 
 
 
483 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  35.57 
 
 
490 aa  253  6e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3287  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.78 
 
 
484 aa  253  6e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000039579  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0737  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.5 
 
 
483 aa  253  6e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.05 
 
 
488 aa  253  7e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  35.57 
 
 
490 aa  253  7e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1305  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.27 
 
 
488 aa  253  7e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1235  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.27 
 
 
488 aa  253  7e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.916768  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.61 
 
 
494 aa  252  8.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31718  predicted protein  37.87 
 
 
468 aa  252  9.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.160049  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3293  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.61 
 
 
488 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.29 
 
 
490 aa  252  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.96 
 
 
514 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04240  IMP dehydrogenase, putative  35.38 
 
 
544 aa  251  2e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0375303  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.05 
 
 
482 aa  251  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1137  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.92 
 
 
488 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1433  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.91 
 
 
496 aa  251  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.67 
 
 
498 aa  250  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.31 
 
 
490 aa  249  6e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.44 
 
 
493 aa  249  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2596  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.29 
 
 
500 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1091  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.94 
 
 
495 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.86 
 
 
491 aa  248  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0979  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.26 
 
 
482 aa  248  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1886  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.76 
 
 
485 aa  248  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.4 
 
 
488 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.02 
 
 
483 aa  246  4.9999999999999997e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4253  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.55 
 
 
500 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3142  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.4 
 
 
488 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.22 
 
 
489 aa  246  4.9999999999999997e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2359  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.86 
 
 
488 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2984  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.4 
 
 
488 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004341  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.64 
 
 
488 aa  246  6e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.43 
 
 
489 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.4 
 
 
488 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281369  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.9 
 
 
486 aa  246  6.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.51 
 
 
489 aa  246  6.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08496  putative inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.25 
 
 
490 aa  246  6.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.62 
 
 
498 aa  246  9e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0638  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.34 
 
 
504 aa  246  9e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.726913  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1049  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.27 
 
 
496 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.7 
 
 
485 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1269  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.86 
 
 
488 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000336634  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.01 
 
 
498 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.64 
 
 
486 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2729  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.18 
 
 
487 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0179443  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1313  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.31 
 
 
490 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.905009  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.01 
 
 
486 aa  244  1.9999999999999999e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0742  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.21 
 
 
510 aa  245  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00516677  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0276  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.26 
 
 
482 aa  245  1.9999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.9 
 
 
484 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119530  inosine 5'-phosphate dehydrogenase  34.88 
 
 
502 aa  244  3e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.991858  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.82 
 
 
496 aa  244  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1193  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.6 
 
 
490 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1949  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.85 
 
 
485 aa  244  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.51 
 
 
489 aa  243  5e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0366  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.07 
 
 
516 aa  243  5e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.213754 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  34.3 
 
 
484 aa  243  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.63 
 
 
486 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1201  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.91 
 
 
485 aa  242  1e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.795344  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1246  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.62 
 
 
491 aa  242  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0664  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.7 
 
 
485 aa  241  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.116725  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0770  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.08 
 
 
481 aa  241  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0061566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>