More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0236 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  100 
 
 		 376 aa  781    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2503  aldo/keto reductase  69.52 
 
 		 374 aa  565  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  44.21 
 
 		 377 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1636  aldo/keto reductase  41.82 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0684  aldo/keto reductase  42.04 
 
 		 376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1570  aldo/keto reductase  41.56 
 
 		 379 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1665  aldo/keto reductase  41.15 
 
 		 377 aa  256  5e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07500  aldo/keto reductase  40.36 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1446  aldo/keto reductase  36.86 
 
 		 383 aa  240  4e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00469922  normal  0.148441 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0319  aldo/keto reductase  38.3 
 
 		 381 aa  237  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1451  aldo/keto reductase  38.44 
 
 		 384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  38.74 
 
 		 409 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  38.4 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3061  aldo/keto reductase  39.42 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000337761  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0276  aldo/keto reductase  37.8 
 
 		 397 aa  229  4e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.874141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  37.43 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1733  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.79 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410484  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  37.53 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2306  aldo/keto reductase  37.1 
 
 		 365 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2019  aldo/keto reductase  37.44 
 
 		 380 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2830  aldo/keto reductase  37.86 
 
 		 379 aa  225  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0663366  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  38.06 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0763  aldo/keto reductase  37.44 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000804851 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1653  aldo/keto reductase  37.17 
 
 		 381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.953335 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  37.44 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1455  aldo/keto reductase  36.62 
 
 		 399 aa  216  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.981784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  36.6 
 
 		 399 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1237  aldo/keto reductase  35.68 
 
 		 401 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496781  normal  0.0437747 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0448  aldo/keto reductase  36.98 
 
 		 374 aa  212  7e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1924  aldo/keto reductase  35.26 
 
 		 413 aa  209  8e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  34.85 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0529  aldo/keto reductase  35.04 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3350  aldo/keto reductase  35.6 
 
 		 398 aa  203  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.343434  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  36.98 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1414  aldo/keto reductase  32.98 
 
 		 386 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  33.95 
 
 		 340 aa  190  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2567  aldo/keto reductase  31.91 
 
 		 371 aa  187  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.17886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3250  aldo/keto reductase  32.72 
 
 		 364 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0241  aldo/keto reductase  32.11 
 
 		 376 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.036795 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3197  aldo/keto reductase  32.55 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000351042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0222  aldo/keto reductase  34.51 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.782387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1630  aldo/keto reductase  34.77 
 
 		 397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2764  aldo/keto reductase  30.55 
 
 		 376 aa  182  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2899  aldo/keto reductase  32.72 
 
 		 374 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04990  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  32.79 
 
 		 364 aa  172  5.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0504  aldo/keto reductase  29.6 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1057  aldo/keto reductase  31.85 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286681 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2587  aldo/keto reductase  31.03 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000465282  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16590  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  32.28 
 
 		 370 aa  159  9e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0769  Fe-S oxidoreductase  31.44 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000125779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1621  aldo/keto reductase  30.48 
 
 		 380 aa  156  7e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0407  aldo/keto reductase  27.42 
 
 		 383 aa  155  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1070  oxidoreductase aldo/keto reductase  27.75 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587482  hitchhiker  0.00485834 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0701  aldo/keto reductase  29.54 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0135874  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1658  aldo/keto reductase  28.83 
 
 		 370 aa  143  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000189792  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0202  aldo/keto reductase  30.63 
 
 		 393 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470074 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  32.88 
 
 		 280 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0206  aldo/keto reductase  28.82 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  34.86 
 
 		 332 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1186  aldo/keto reductase  30.56 
 
 		 393 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.472263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.27 
 
 		 350 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  34.29 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1664  aldo/keto reductase  27.06 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0440  aldo/keto reductase  28.42 
 
 		 380 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3604  aldo/keto reductase  28.86 
 
 		 394 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436577  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0361  aldo/keto reductase  31.55 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04651  aldo/keto reductase  28.35 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.205889  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  31.56 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1050  aldo/keto reductase  29.89 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.780587  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3654  aldo/keto reductase  26.14 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2795  aldo/keto reductase  31.43 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4508  aldo/keto reductase  30.9 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532493  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04381  aldo/keto reductase  27.97 
 
 		 378 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05031  aldo/keto reductase  27.68 
 
 		 380 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4324  aldo/keto reductase  28.89 
 
 		 393 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  33.33 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0288  aldo/keto reductase  30.43 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06340  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  27.87 
 
 		 341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0288  aldo/keto reductase  30.43 
 
 		 328 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  30.82 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4206  lolS protein  30.72 
 
 		 304 aa  120  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.510794  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0602  oxidoreductase  26.49 
 
 		 373 aa  119  7e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1522  aldo/keto reductase  33.68 
 
 		 285 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1483  aldo/keto reductase  33.68 
 
 		 285 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000333106  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04961  aldo/keto reductase  27.95 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.583752  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  31.06 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1760  oxidoreductase  25.84 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  32.71 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  34.31 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5317  aldo/keto reductase  31.05 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  31.91 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1031  lolS protein  30.92 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  31.45 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0667  aldo/keto reductase  29.64 
 
 		 302 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  31.76 
 
 		 339 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  31.76 
 
 		 339 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4535  aldo/keto reductase  29.43 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0927734  decreased coverage  0.00892549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5322  aldo/keto reductase  30.58 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0362532 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  32.2 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  29.23 
 
 		 312 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>