More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2546 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2546  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
559 aa  1151    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0608  glucose-6-phosphate isomerase  54.25 
 
 
543 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.028095  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0118  glucose-6-phosphate isomerase  55.33 
 
 
555 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0109  glucose-6-phosphate isomerase  55.47 
 
 
555 aa  596  1e-169  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0272  glucose-6-phosphate isomerase  55.34 
 
 
563 aa  585  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.469767  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  47.3 
 
 
548 aa  512  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  48.11 
 
 
541 aa  509  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  45.5 
 
 
550 aa  510  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  47.05 
 
 
549 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  46.03 
 
 
548 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  45.16 
 
 
550 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  45.83 
 
 
552 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  45.47 
 
 
549 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  48.08 
 
 
649 aa  506  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  42.93 
 
 
567 aa  504  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  44.68 
 
 
550 aa  504  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  46.59 
 
 
549 aa  499  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  44.4 
 
 
547 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  44.8 
 
 
550 aa  501  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  44.78 
 
 
549 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  44.78 
 
 
549 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  44.78 
 
 
549 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  44.9 
 
 
531 aa  495  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  44.78 
 
 
549 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  44.78 
 
 
549 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  46.04 
 
 
549 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  43.99 
 
 
545 aa  496  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  44.64 
 
 
545 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  45.62 
 
 
548 aa  493  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  44.52 
 
 
545 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  45.23 
 
 
549 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  45.68 
 
 
552 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  44.35 
 
 
545 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  43.75 
 
 
549 aa  492  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  44.52 
 
 
545 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  44.96 
 
 
545 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  44.78 
 
 
545 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  44.6 
 
 
545 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  44.24 
 
 
549 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  44.24 
 
 
549 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  44.74 
 
 
545 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  44.06 
 
 
549 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  44.06 
 
 
549 aa  491  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  44.06 
 
 
549 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  44.06 
 
 
549 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  47.11 
 
 
551 aa  491  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0826  glucose-6-phosphate isomerase  46.56 
 
 
554 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000464975 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  44.06 
 
 
549 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  45.86 
 
 
548 aa  489  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  44.42 
 
 
549 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  44.86 
 
 
549 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  43.63 
 
 
548 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  44.06 
 
 
549 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  44.19 
 
 
548 aa  490  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  43.19 
 
 
550 aa  490  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  44.06 
 
 
549 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  44.8 
 
 
548 aa  486  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  43.97 
 
 
545 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  46.18 
 
 
543 aa  488  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0959  glucose-6-phosphate isomerase  46.67 
 
 
554 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  44.8 
 
 
548 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  44.8 
 
 
548 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  46.13 
 
 
550 aa  488  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  44.64 
 
 
545 aa  487  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  46.36 
 
 
543 aa  484  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  46.2 
 
 
554 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  45.66 
 
 
546 aa  483  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  45.92 
 
 
550 aa  484  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  43.04 
 
 
547 aa  484  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  44.52 
 
 
562 aa  484  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17650  glucose-6-phosphate isomerase  46.38 
 
 
554 aa  482  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0697549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  43.88 
 
 
548 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0665  glucose-6-phosphate isomerase  46.78 
 
 
553 aa  485  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4813  glucose-6-phosphate isomerase  45.83 
 
 
554 aa  481  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  42.42 
 
 
550 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  43.55 
 
 
550 aa  479  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16630  glucose-6-phosphate isomerase  46.2 
 
 
554 aa  478  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42740  glucose-6-phosphate isomerase  46.21 
 
 
554 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967363  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1808  glucose-6-phosphate isomerase  45.11 
 
 
554 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.339602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4701  glucose-6-phosphate isomerase  45.11 
 
 
554 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101931 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  47.5 
 
 
560 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4566  glucose-6-phosphate isomerase  45.11 
 
 
554 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489818  normal  0.0824899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  42.76 
 
 
545 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0732  glucose-6-phosphate isomerase  45.11 
 
 
554 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309434  hitchhiker  0.0000815529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62620  glucose-6-phosphate isomerase  45.03 
 
 
554 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  43.6 
 
 
559 aa  472  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5449  glucose-6-phosphate isomerase  45.21 
 
 
554 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  46.89 
 
 
546 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  46.47 
 
 
547 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  45.11 
 
 
554 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  43.65 
 
 
547 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1184  glucose-6-phosphate isomerase  43.64 
 
 
545 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00253768  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  46.63 
 
 
546 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0932  glucose-6-phosphate isomerase  44.94 
 
 
548 aa  465  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0922928  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  45.16 
 
 
541 aa  467  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  47.99 
 
 
556 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  44.42 
 
 
547 aa  465  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  42.6 
 
 
554 aa  466  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  47.99 
 
 
540 aa  465  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2735  glucose-6-phosphate isomerase  43.11 
 
 
545 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000381745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>