24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6843 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6843  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  741    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1867  Beta-ketoacyl synthase  40.4 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1087  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase-like protein  38.87 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03860  Beta-ketoacyl synthase  37.75 
 
 		 356 aa  236  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0777585  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2004  hypothetical protein  37.46 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2114  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase  34.08 
 
 		 354 aa  204  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.576608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0383  hypothetical protein  36.1 
 
 		 344 aa  199  6e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0162715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1761  Beta-ketoacyl synthase  34.47 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1988  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase-like protein  34.47 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0927  beta-ketoacyl synthase  25.76 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1528  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  21.95 
 
 		 422 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.640363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3605  beta-ketoacyl synthase  28.06 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2649  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  25.38 
 
 		 269 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  26.95 
 
 		 241 aa  47  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2192  Beta-ketoacyl synthase  26.35 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.264363  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0607  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  21.81 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000170362 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1358  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  25.14 
 
 		 473 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37367  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase  24.11 
 
 		 433 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.755948  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1833  beta-ketoacyl synthase  21.97 
 
 		 412 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0449277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1393  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  21.88 
 
 		 414 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  43.5  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1872  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  25.17 
 
 		 414 aa  43.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.291038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2019  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  20.86 
 
 		 411 aa  43.1  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000311952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0418  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  22.57 
 
 		 420 aa  43.1  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>