29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6726 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6726  hypothetical protein  100 
 
 
441 aa  925    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0771902  normal  0.314379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3033  hypothetical protein  57.82 
 
 
440 aa  558  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.715848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4739  vanadium-dependent haloperoxidase family protein  46.87 
 
 
434 aa  402  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  39.16 
 
 
451 aa  325  8.000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  0.668307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4735  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.72 
 
 
452 aa  288  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.829288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5972  hypothetical protein  30.62 
 
 
471 aa  192  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6085  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.95 
 
 
449 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.53 
 
 
5216 aa  149  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1609  hypothetical protein  31.15 
 
 
433 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2325  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.22 
 
 
426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1749  phosphoesterase PA-phosphatase-like protein  28.45 
 
 
403 aa  117  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4523  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.39 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2561  hypothetical protein  29.2 
 
 
480 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490914  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2488  hypothetical protein  28.16 
 
 
493 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1347  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.65 
 
 
513 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1660  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.54 
 
 
407 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0022  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.59 
 
 
520 aa  90.1  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1698  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.98 
 
 
411 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00849599  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1740  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.48 
 
 
431 aa  77.8  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  24.76 
 
 
678 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4663  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.53 
 
 
515 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626418  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5242  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.34 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2900  hypothetical protein  29.53 
 
 
473 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3504  chloride peroxidase  33.06 
 
 
598 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05520  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.34 
 
 
308 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000494508  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2995  hypothetical protein  31.78 
 
 
667 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617304  hitchhiker  0.00000029866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4660  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  24.55 
 
 
502 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.673229  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2161  hypothetical protein  34.34 
 
 
870 aa  46.6  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3529  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.59 
 
 
361 aa  43.9  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal  0.0139793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>