29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6085 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6085  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 
449 aa  924    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5972  hypothetical protein  41.75 
 
 
471 aa  309  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1609  hypothetical protein  37.23 
 
 
433 aa  203  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4735  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.91 
 
 
452 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.829288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.12 
 
 
451 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  0.668307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3033  hypothetical protein  30.51 
 
 
440 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.715848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6726  hypothetical protein  27.95 
 
 
441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0771902  normal  0.314379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4739  vanadium-dependent haloperoxidase family protein  26.76 
 
 
434 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.22 
 
 
5216 aa  137  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0022  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.92 
 
 
520 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2325  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.51 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1749  phosphoesterase PA-phosphatase-like protein  23.96 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1347  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.81 
 
 
513 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4663  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.68 
 
 
515 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626418  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1740  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.42 
 
 
431 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1660  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.78 
 
 
407 aa  95.5  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5242  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.88 
 
 
428 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  23.95 
 
 
678 aa  93.6  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1698  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.08 
 
 
411 aa  91.3  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00849599  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2561  hypothetical protein  29.87 
 
 
480 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490914  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2488  hypothetical protein  23.87 
 
 
493 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4523  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.64 
 
 
421 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05520  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.57 
 
 
308 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000494508  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3504  chloride peroxidase  35.67 
 
 
598 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4660  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.7 
 
 
502 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.673229  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2900  hypothetical protein  24.91 
 
 
473 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2161  hypothetical protein  32.35 
 
 
870 aa  50.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2849  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.57 
 
 
523 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2995  hypothetical protein  30 
 
 
667 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617304  hitchhiker  0.00000029866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>