19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4631 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4631  protein of unknown function DUF805  100 
 
 		 100 aa  204  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.276161  normal  0.187204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2546  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0430  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.27 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  36.63 
 
 		 286 aa  60.8  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  32.38 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  36 
 
 		 146 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  32.41 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  33.02 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  33.02 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  33.02 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  33.02 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  33.02 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  33.02 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2197  protein of unknown function DUF805  28.57 
 
 		 346 aa  42  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  33 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  31.19 
 
 		 117 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  31.19 
 
 		 117 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  31.82 
 
 		 386 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>