13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3903 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3903  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  887    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0432059  normal  0.0187959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  28.03 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  29.09 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  33.55 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  31.68 
 
 		 790 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  33.96 
 
 		 483 aa  50.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  27.18 
 
 		 654 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  27.18 
 
 		 654 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  29.45 
 
 		 530 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  26.36 
 
 		 735 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  36.75 
 
 		 144 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  35.85 
 
 		 536 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  32.65 
 
 		 225 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>