55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1701 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1701  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 63 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0108119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0843  preprotein translocase, SecE subunit  46.03 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.481373 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0200  preprotein translocase subunit SecE  54.35 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185504  hitchhiker  0.0000981589 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0187  preprotein translocase subunit SecE  48.98 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000823053  hitchhiker  0.000548476 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1937  preprotein translocase, SecE subunit  30.16 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4469  preprotein translocase subunit SecE  48.98 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0183  preprotein translocase subunit SecE  48.98 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4069  preprotein translocase subunit SecE  48.98 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  hitchhiker  0.00908786 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0218  preprotein translocase subunit SecE  51.02 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0420  preprotein translocase, SecE subunit  29.82 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000015619  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1402  hypothetical protein  30.16 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3772  preprotein translocase subunit SecE  51.02 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452492  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0157  preprotein translocase subunit SecE  42 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000628053  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0145  preprotein translocase subunit SecE  53.33 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000598149  normal  0.0330046 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0186  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  hitchhiker  0.00751304 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0181  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000171  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0186  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000112124  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4330  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000313064  hitchhiker  0.00000000188244 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0135  preprotein translocase subunit SecE  44.9 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000169097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4483  preprotein translocase, SecE subunit  31.15 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00005242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0171  preprotein translocase subunit SecE  51.11 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000158213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00689  Preprotein translocase subunit SecE  45.65 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000478021  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4703  preprotein translocase subunit SecE  51.11 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000037355  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00055  elongation factor Tu  30.91 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3174a  preprotein translocase  43.75 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  36.67 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2427  preprotein translocase subunit SecE  39.22 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000113159  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0194  preprotein translocase subunit SecE  36.73 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000062993  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3455  preprotein translocase, SecE subunit  27.87 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00261643  normal  0.0335221 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2724  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 		 131 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108515  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2872b  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 		 125 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00131077  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4389  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515047  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03857  translocase  43.48 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000542011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4014  preprotein translocase, SecE subunit  43.48 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000048748  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002167  preprotein translocase subunit SecE  41.3 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000092259  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0204  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00011223  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03810  hypothetical protein  43.48 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5446  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000383194  hitchhiker  0.0067856 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4553  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00306238  hitchhiker  0.000000000000770632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4520  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0191  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000178123  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4357  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000161707  normal  0.74438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4476  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000966143  hitchhiker  0.00190417 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4479  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000837942  decreased coverage  0.00000000000000405738 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4469  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000281914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4429  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000053467  hitchhiker  0.0000280733 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4044  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000141034  hitchhiker  0.00697666 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4214  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.05954e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0199  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00725856  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3866  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.21747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  42.86 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0333  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000137856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2804  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191785  normal  0.0790705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0271  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179127  normal  0.0228965 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00231  preprotein translocase subunit SecE  41.3 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>