34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1598 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1598  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  288  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5766  hypothetical protein  41.9 
 
 		 149 aa  87  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4466  hypothetical protein  36.17 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1875  hypothetical protein  45.36 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0161  hypothetical protein  33.61 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00228251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3757  hypothetical protein  35.25 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.639836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1422  hypothetical protein  30.58 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501791  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  34.88 
 
 		 321 aa  62  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08091  hypothetical protein  33.08 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1841  Thioredoxin domain  27.74 
 
 		 314 aa  55.1  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.928879  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0166  hypothetical protein  26.53 
 
 		 350 aa  52.4  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0134966  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1484  hypothetical protein  32.2 
 
 		 339 aa  51.6  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3686  restriction endonuclease  36.84 
 
 		 421 aa  50.1  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  27.35 
 
 		 603 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.47 
 
 		 610 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.68 
 
 		 613 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.14 
 
 		 619 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.68 
 
 		 613 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.55 
 
 		 613 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.55 
 
 		 619 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.85 
 
 		 607 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30 
 
 		 602 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2461  hypothetical protein  25.87 
 
 		 435 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.321455  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.48 
 
 		 734 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2057  hypothetical protein  27.35 
 
 		 167 aa  41.6  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 610 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  28.57 
 
 		 600 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  41.46 
 
 		 529 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  28.43 
 
 		 691 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  27.96 
 
 		 686 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.82 
 
 		 595 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.82 
 
 		 595 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.82 
 
 		 595 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  35.19 
 
 		 750 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>