26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1436 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3392  Lantibiotic dehydratase domain protein  36.4 
 
 
1042 aa  651    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262468  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1436  Lantibiotic dehydratase domain protein  100 
 
 
1038 aa  2161    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0903  Lantibiotic dehydratase domain protein  36.79 
 
 
1036 aa  629  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4714  Lantibiotic dehydratase domain protein  35.22 
 
 
1055 aa  615  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  33.3 
 
 
1148 aa  610  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2131  Lantibiotic dehydratase domain protein  34.03 
 
 
1013 aa  546  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0879912  normal  0.662037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4704  Lantibiotic dehydratase domain protein  31.58 
 
 
1060 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0556  Lantibiotic dehydratase domain protein  37.52 
 
 
757 aa  497  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1821  lantibiotic dehydratase-like  23.56 
 
 
1074 aa  178  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525811  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0557  hypothetical protein  36.55 
 
 
317 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4694  Lantibiotic dehydratase domain protein  24.38 
 
 
987 aa  161  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908748  normal  0.810572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1127  lantibiotic dehydratase-like  22.52 
 
 
1029 aa  148  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2033  lantibiotic dehydratase-like  21.65 
 
 
1031 aa  147  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423471  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2799  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  22.3 
 
 
1021 aa  135  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1332  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  27.4 
 
 
1066 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591859  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5417  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  22.07 
 
 
968 aa  121  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.944486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0056  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  22.33 
 
 
1035 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3315  lantibiotic dehydratase-like  21.05 
 
 
1027 aa  114  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.301651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0602  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  22.38 
 
 
1009 aa  108  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4647  Lantibiotic dehydratase domain protein  21.59 
 
 
1042 aa  107  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3936  Lantibiotic dehydratase domain protein  20.57 
 
 
729 aa  95.1  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139143  normal  0.0810168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3602  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  21.89 
 
 
964 aa  94.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.22565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6755  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  23.34 
 
 
915 aa  68.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3692  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.15 
 
 
904 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3530  hypothetical protein  24.3 
 
 
373 aa  45.8  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2588  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  28.35 
 
 
919 aa  44.7  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233589  normal  0.182306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>