18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1394 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1394  YD repeat protein  100 
 
 		 1129 aa  2300    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4144  YD repeat protein  24.7 
 
 		 1092 aa  222  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  0.283099 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1097  YD repeat protein  25.04 
 
 		 1229 aa  174  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.791752  unclonable  0.0000000000274764 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2667  YD repeat-containing protein  28.23 
 
 		 1152 aa  168  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3730  YD repeat-containing protein  28.23 
 
 		 1152 aa  168  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0100146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3186  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1079 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.187937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3006  YD repeat protein  30.06 
 
 		 1263 aa  157  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1049  YD repeat protein  28.07 
 
 		 1084 aa  132  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7100  YD repeat protein  26.27 
 
 		 1065 aa  111  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4387  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1056 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95296  hitchhiker  0.00457818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2121  YD repeat protein  38.73 
 
 		 1837 aa  104  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0873035  normal  0.943874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4640  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1322 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.963654  normal  0.0174413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2075  YD repeat protein  41.25 
 
 		 1129 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3209  hypothetical protein  43.94 
 
 		 2395 aa  51.6  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304767  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0601  hypothetical protein  30.25 
 
 		 1857 aa  48.9  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.850446  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1521  hypothetical protein  36.94 
 
 		 1807 aa  48.1  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442861  normal  0.0305188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  43.94 
 
 		 2252 aa  48.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  38.04 
 
 		 554 aa  47.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>