More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2530 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  100 
 
 
353 aa  718    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  49.72 
 
 
354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  48.97 
 
 
353 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  48.67 
 
 
353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  48.97 
 
 
353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  44.76 
 
 
356 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  48.38 
 
 
353 aa  319  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  48.67 
 
 
353 aa  319  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  48.67 
 
 
353 aa  318  7e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  48.67 
 
 
353 aa  318  7e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  48.67 
 
 
353 aa  318  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  47.16 
 
 
353 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  47.65 
 
 
353 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  46.78 
 
 
353 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  46.76 
 
 
353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  45.61 
 
 
353 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  43.23 
 
 
357 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  43.95 
 
 
357 aa  296  4e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  44.08 
 
 
357 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  45.56 
 
 
354 aa  288  8e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  45.59 
 
 
359 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  40.63 
 
 
347 aa  282  7.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  42.9 
 
 
353 aa  280  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  42.9 
 
 
353 aa  280  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  42.9 
 
 
353 aa  279  5e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  43.24 
 
 
353 aa  279  5e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0744  peptidase M24  47.55 
 
 
352 aa  277  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1923  peptidase M24  44.35 
 
 
361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.412191  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  40.34 
 
 
356 aa  268  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  40.3 
 
 
362 aa  267  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  39.2 
 
 
356 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  39.82 
 
 
356 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  40.57 
 
 
356 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  38.24 
 
 
359 aa  260  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  40.29 
 
 
356 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  39.71 
 
 
356 aa  259  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  40.29 
 
 
356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  37.96 
 
 
359 aa  259  6e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  39.43 
 
 
356 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  39.43 
 
 
356 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  39.71 
 
 
356 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  39.34 
 
 
363 aa  257  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  41.54 
 
 
356 aa  256  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  39.43 
 
 
356 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  40.69 
 
 
357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  38.71 
 
 
347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  39.14 
 
 
356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  40.36 
 
 
362 aa  253  3e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  40.8 
 
 
364 aa  253  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  37.96 
 
 
367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  41.38 
 
 
355 aa  252  7e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  40.53 
 
 
352 aa  250  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  37.43 
 
 
359 aa  248  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1740  aminopeptidase P  37.01 
 
 
366 aa  247  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  38.97 
 
 
357 aa  246  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0604  peptidase M24  39.72 
 
 
354 aa  246  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.10841  decreased coverage  0.00345461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  41.94 
 
 
355 aa  246  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  38.14 
 
 
369 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  36.61 
 
 
348 aa  243  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  37.54 
 
 
348 aa  243  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  37.43 
 
 
361 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  36.34 
 
 
360 aa  240  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  38.73 
 
 
358 aa  240  4e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  37.15 
 
 
361 aa  239  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  37.32 
 
 
355 aa  239  4e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  37.15 
 
 
361 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  37.15 
 
 
361 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  37.15 
 
 
361 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  37.25 
 
 
361 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  36.69 
 
 
361 aa  235  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  36.87 
 
 
361 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  36.87 
 
 
361 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  39.65 
 
 
356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0710  peptidase M24  38.81 
 
 
364 aa  232  8.000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0169  peptidase M24  38.28 
 
 
372 aa  232  9e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.871292  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  36.36 
 
 
356 aa  232  9e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  35.43 
 
 
361 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2129  Xaa-Pro dipeptidase  38.66 
 
 
363 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  39.26 
 
 
355 aa  229  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0480  peptidase M24  37.57 
 
 
371 aa  228  9e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1673  peptidase M24  36.75 
 
 
381 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0480617  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  35.96 
 
 
357 aa  225  8e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1188  peptidase M24  36.9 
 
 
358 aa  225  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00256362  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0959  aminopeptidase P  37.18 
 
 
362 aa  220  3e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00122435  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1137  peptidase M24  35.45 
 
 
359 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850541 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1036  peptidase M24  41.37 
 
 
354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.660933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0982  peptidase M24  39.66 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000249313  normal  0.0334908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3060  peptidase M24  38.19 
 
 
363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  38.83 
 
 
364 aa  212  9e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0334  peptidase M24  38.51 
 
 
360 aa  212  9e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2944  peptidase M24  37.17 
 
 
360 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000942293  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0585  peptidase M24  37.25 
 
 
364 aa  209  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  33.33 
 
 
365 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  33.33 
 
 
365 aa  209  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  33.89 
 
 
365 aa  209  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  33.33 
 
 
365 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  33.05 
 
 
365 aa  209  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1099  peptidase M24  35.67 
 
 
356 aa  209  8e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  37.57 
 
 
364 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  33.33 
 
 
365 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>