More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0710 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0710  peptidase M24  100 
 
 
364 aa  744    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0585  peptidase M24  69.66 
 
 
364 aa  489  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1740  aminopeptidase P  63.66 
 
 
366 aa  474  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  64.56 
 
 
364 aa  477  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1603  aminopeptidase P  66.01 
 
 
364 aa  426  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.791664 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  56.7 
 
 
356 aa  398  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0604  peptidase M24  57.83 
 
 
354 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.10841  decreased coverage  0.00345461 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  42.24 
 
 
357 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  41.24 
 
 
353 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  41.48 
 
 
356 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  37.29 
 
 
353 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  38.81 
 
 
353 aa  257  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  40.86 
 
 
354 aa  258  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  39.66 
 
 
357 aa  253  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  38.14 
 
 
353 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  40.59 
 
 
359 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  38.67 
 
 
356 aa  250  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1036  peptidase M24  41.29 
 
 
354 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.660933  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  41.74 
 
 
356 aa  246  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  35.88 
 
 
353 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  35.59 
 
 
353 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  35.03 
 
 
353 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  35.31 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  35.03 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  35.31 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  35.31 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  35.31 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  35.59 
 
 
353 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  35.03 
 
 
353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0744  peptidase M24  40.78 
 
 
352 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  42.28 
 
 
359 aa  243  5e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  37.61 
 
 
354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  41.67 
 
 
359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  34.29 
 
 
356 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  34.86 
 
 
356 aa  239  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  40.58 
 
 
356 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  42.6 
 
 
359 aa  238  9e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  34.29 
 
 
356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  33.43 
 
 
356 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  33.71 
 
 
356 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  36.06 
 
 
357 aa  233  5e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  36.26 
 
 
353 aa  232  6e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  33.43 
 
 
356 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  33.43 
 
 
356 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2024  peptidase M24  42.86 
 
 
359 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  33.71 
 
 
356 aa  230  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  33.43 
 
 
356 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  34 
 
 
356 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  36.76 
 
 
357 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  36.24 
 
 
355 aa  226  6e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  38.19 
 
 
347 aa  226  6e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1923  peptidase M24  40.59 
 
 
361 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.412191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  39.12 
 
 
355 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  40.71 
 
 
356 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  34.36 
 
 
358 aa  220  3e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  35.86 
 
 
357 aa  220  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  34.71 
 
 
353 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  34.71 
 
 
353 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  36.26 
 
 
347 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  36.02 
 
 
355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  35.55 
 
 
353 aa  216  4e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  36.36 
 
 
367 aa  216  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0982  peptidase M24  40.99 
 
 
357 aa  215  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000249313  normal  0.0334908 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  36.13 
 
 
360 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3060  peptidase M24  38.75 
 
 
363 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  38.46 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  38.97 
 
 
369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  37.5 
 
 
364 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  40 
 
 
357 aa  210  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  37.33 
 
 
362 aa  209  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  36.5 
 
 
362 aa  207  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  38.97 
 
 
348 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0480  peptidase M24  35.13 
 
 
371 aa  207  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  32.62 
 
 
365 aa  206  4e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2129  Xaa-Pro dipeptidase  37.64 
 
 
363 aa  206  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  37.54 
 
 
354 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  33.43 
 
 
352 aa  204  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1099  peptidase M24  33.8 
 
 
356 aa  204  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  35.16 
 
 
361 aa  202  7e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  35.16 
 
 
361 aa  202  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  35.16 
 
 
361 aa  202  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  36.21 
 
 
348 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  36.09 
 
 
362 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  35.61 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  34.43 
 
 
361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  34.89 
 
 
361 aa  199  9e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  34.89 
 
 
361 aa  199  9e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  34.62 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  34.62 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0334  peptidase M24  36.84 
 
 
360 aa  197  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  33.61 
 
 
361 aa  196  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1188  peptidase M24  34.93 
 
 
358 aa  196  7e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00256362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2944  peptidase M24  35.23 
 
 
360 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000942293  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  33.43 
 
 
361 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2852  proline dipeptidase, putative  38.52 
 
 
358 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.067191 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2332  peptidase M24  37.92 
 
 
376 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0415611  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  37.11 
 
 
364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  32.17 
 
 
374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0747  aminopeptidase P  39.33 
 
 
365 aa  189  5.999999999999999e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00500087  hitchhiker  0.000760117 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  32.88 
 
 
362 aa  188  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>