24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2089 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2089  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 354 aa  738    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3674  oxidoreductase domain-containing protein  32.77 
 
 		 376 aa  209  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1039  oxidoreductase domain-containing protein  30.62 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3218  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 		 372 aa  159  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000314517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3481  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0700389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2542  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 		 380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0594  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 		 387 aa  126  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0345  putative oxidoreductase  31.82 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.42492  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0402  oxidoreductase, putative  31.82 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.738462  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  22.26 
 
 		 467 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  20 
 
 		 425 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  20 
 
 		 425 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2277  oxidoreductase domain-containing protein  25.5 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 		 667 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  24.48 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.36 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14141  hypothetical protein  24.09 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0733331  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  23.08 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  20.53 
 
 		 358 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3670  oxidoreductase domain-containing protein  25.96 
 
 		 306 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.998821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  19.88 
 
 		 421 aa  43.5  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  24.32 
 
 		 340 aa  43.1  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  21.71 
 
 		 470 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 		 365 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>