48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2002 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2002  YCII-related  100 
 
 		 98 aa  201  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000615778  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0987  hypothetical protein  64.95 
 
 		 97 aa  142  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000944025  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2510  YCII-related  29.47 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0553875  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1981  YCII-related protein  28.05 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  31.82 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31170  hypothetical protein  25.29 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.814554  normal  0.945113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0823  YCII-related  30 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00411104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6165  YCII-related protein  30.38 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2835  YCII-related  31.82 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5251  YCII-related  30.68 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000875339  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2222  YCII-related  31.82 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2508  YCII-related  29.73 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0916  YCII-related  26.14 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263872 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2846  YCII-related  30.3 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0437  YCII-related domain-containing protein  26.44 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255268  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24840  hypothetical protein  23.08 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0684  YCII-related domain-containing protein  26.44 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.906531  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1434  hypothetical protein  26.44 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3186  hypothetical protein  26.44 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2861  hypothetical protein  26.44 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0501  hypothetical protein  26.44 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0158  hypothetical protein  26.44 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342692  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0519  hypothetical protein  26.44 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2892  YCII-related  29.11 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2752  YCII-related  29.11 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3417  GTP cyclohydrolase II  28.75 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0288  YCII-related  27.4 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1294  YCII-related protein  29.41 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1394  YCII-related  24.44 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1442  YCII-related  27.69 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0822188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  26.25 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0089  YCII-related  26.58 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3299  YCII-related protein  29.85 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1923  YCII-related  23.33 
 
 		 97 aa  42.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.821027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2451  YCII-related  28.57 
 
 		 97 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3929  YCII-related protein  27.85 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  30.43 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0556  YCII-related  24.14 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0328033  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1911  YCII-related  28.57 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2012  YCII-related  28.57 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00711302  hitchhiker  0.00184291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2335  YCII-related  28.57 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  33.96 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  33.96 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3346  YCII-related  24.24 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  32.08 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2658  YCII-related  28.33 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978199  normal  0.505193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2728  YCII-related  31.34 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1599  hypothetical protein  28.79 
 
 		 88 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.32365  normal  0.712255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>