More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0182 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0182  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 288 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1746  PP-loop family protein  48.72 
 
 		 345 aa  293  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0604543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1477  PP-loop family protein  48.72 
 
 		 345 aa  293  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170101  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0233  PP-loop domain protein  48.53 
 
 		 269 aa  287  1e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0731  PP-loop domain protein  45.09 
 
 		 286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1698  PP-loop domain protein  46.67 
 
 		 284 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  41.39 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  40.89 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  31.73 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  31.09 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0942  PP-loop domain-containing protein  35.74 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.907512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  33.76 
 
 		 237 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  33.72 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0868  C32 tRNA thiolase  34 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1167  C32 tRNA thiolase  34 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.958339  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  34.55 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  33.21 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  33.76 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  33.76 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  34.55 
 
 		 336 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  32.2 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  32.8 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  31.54 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 331 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  37.04 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3405  PP-loop domain protein  33.76 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02293  C32 tRNA thiolase  33.87 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  32.24 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  34.75 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  33.98 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  34.32 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  31.28 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  30.49 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  32.69 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  34.01 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  33.2 
 
 		 331 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  27.64 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  32.3 
 
 		 336 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  34.96 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  27.64 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  32.31 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  32.31 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  32.31 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  32.31 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  32.31 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  32.79 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  28.05 
 
 		 290 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  32.31 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  32.31 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0974  PP-loop domain protein  32.1 
 
 		 309 aa  138  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  32.53 
 
 		 319 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003477  tRNA(Cytosine32)-2-thiocytidine synthetase  33.47 
 
 		 297 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0168289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  36.41 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4089  C32 tRNA thiolase  29.89 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  30.87 
 
 		 247 aa  138  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  36.6 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03846  C32 tRNA thiolase  33.02 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  33.87 
 
 		 274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  32.52 
 
 		 302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  30.77 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  35.75 
 
 		 317 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  35.75 
 
 		 317 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  31.25 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  31.92 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  33.2 
 
 		 274 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1405  C32 tRNA thiolase  32.26 
 
 		 274 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.237455 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  34.48 
 
 		 259 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  33.47 
 
 		 312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  31.73 
 
 		 310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  33.91 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2064  PP-loop superfamily ATPase  32.27 
 
 		 318 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  32.53 
 
 		 322 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0058  C32 tRNA thiolase  36.11 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  32.53 
 
 		 322 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  32.53 
 
 		 322 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  32.53 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  32.53 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 		 319 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  31.3 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  30.92 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  33.2 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  33.2 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  32.8 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  32.8 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  32.8 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  32.52 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  33.47 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  32.91 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  32.52 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  32.52 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  30.88 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  31.91 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1708  PP-loop domain protein  32.38 
 
 		 302 aa  132  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  31.91 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  32 
 
 		 317 aa  132  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>