25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2547 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2547  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  158  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1147  hypothetical protein  59.74 
 
 
79 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.62198  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4662  hypothetical protein  66.2 
 
 
74 aa  94.7  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.2161  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0550  hypothetical protein  61.97 
 
 
74 aa  88.6  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129436  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1158  hypothetical protein  57.75 
 
 
73 aa  80.9  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00402428  hitchhiker  0.0000171721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3239  hypothetical protein  53.42 
 
 
76 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1259  hypothetical protein  56.34 
 
 
74 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0426  hypothetical protein  43.84 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1825  hypothetical protein  44.29 
 
 
73 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4786  hypothetical protein  38.46 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0609  hypothetical protein  41.79 
 
 
74 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2918  hypothetical protein  36.62 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0055  hypothetical protein  40.74 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2062  hypothetical protein  41.27 
 
 
69 aa  53.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000919693  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0194  hypothetical protein  41.33 
 
 
78 aa  52  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.989566  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0024  hypothetical protein  35.62 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1132  hypothetical protein  39.06 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4664  hypothetical protein  40.54 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.203838 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5132  hypothetical protein  44.62 
 
 
66 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569085  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2471  hypothetical protein  38.57 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0192459 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1487  hypothetical protein  36.07 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0820  hypothetical protein  38.89 
 
 
74 aa  43.9  0.0008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1887  hypothetical protein  39.06 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127814  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4683  hypothetical protein  34.38 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1092  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>