35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1849 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 
331 aa  675    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  67.37 
 
 
331 aa  483  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  64.95 
 
 
331 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  63.03 
 
 
331 aa  449  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  62.54 
 
 
331 aa  449  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  61.63 
 
 
331 aa  451  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  59.7 
 
 
332 aa  429  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  61.31 
 
 
332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  59.42 
 
 
330 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  58.46 
 
 
330 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  54.22 
 
 
333 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  59.15 
 
 
337 aa  378  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  56.57 
 
 
334 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  52.96 
 
 
335 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  51.54 
 
 
334 aa  353  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  49.25 
 
 
342 aa  339  4e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  51.3 
 
 
339 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  34.84 
 
 
255 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  32.23 
 
 
233 aa  135  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  34.34 
 
 
248 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  33.84 
 
 
249 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  32.71 
 
 
244 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  30.07 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  26.52 
 
 
271 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  25.26 
 
 
254 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  25.77 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  25.77 
 
 
256 aa  57.8  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0248  Nitrate reductase gamma subunit  22.68 
 
 
299 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  23.17 
 
 
261 aa  56.2  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  28.52 
 
 
257 aa  55.8  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  27.49 
 
 
262 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  25.31 
 
 
220 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  27.69 
 
 
255 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1963  quinone-interacting membrane-bound oxidoreductase complex subunit C  32 
 
 
407 aa  46.2  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829701 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  22.48 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>