More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0423 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 436 aa  890    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  54.16 
 
 		 422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  53.59 
 
 		 422 aa  433  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0391  FolC bifunctional protein  52.27 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.455156  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1757  folylpolyglutamate synthetase  49.77 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000520472  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0458  folylpolyglutamate synthetase  48.69 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0322  FolC bifunctional protein  51.49 
 
 		 411 aa  380  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  37.68 
 
 		 424 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  35.47 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  34.63 
 
 		 433 aa  242  9e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.63 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  37 
 
 		 431 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  34.63 
 
 		 433 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.4 
 
 		 433 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  34.4 
 
 		 433 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  34.4 
 
 		 433 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  36.13 
 
 		 459 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  34.4 
 
 		 433 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.17 
 
 		 433 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  39.49 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.86 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  33.94 
 
 		 433 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  36.58 
 
 		 424 aa  236  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  34.78 
 
 		 428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  36.21 
 
 		 424 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  37.53 
 
 		 424 aa  233  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  37.2 
 
 		 428 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  34.18 
 
 		 431 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  36.64 
 
 		 434 aa  229  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  33.33 
 
 		 429 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  34.17 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  32.04 
 
 		 441 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  33.86 
 
 		 429 aa  222  8e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  32 
 
 		 408 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  32.11 
 
 		 441 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  37.71 
 
 		 414 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  37.36 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  32.8 
 
 		 431 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  34.24 
 
 		 428 aa  212  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  32.32 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  34.77 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  33.87 
 
 		 432 aa  207  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  33.57 
 
 		 422 aa  206  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  32.78 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  33.72 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  31.93 
 
 		 447 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  36.12 
 
 		 426 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  32.81 
 
 		 443 aa  204  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  35.42 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  31.98 
 
 		 425 aa  202  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  33.72 
 
 		 435 aa  201  9.999999999999999e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  30.93 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  32.52 
 
 		 457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  32.94 
 
 		 429 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  32.07 
 
 		 433 aa  199  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  34.67 
 
 		 444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  31.69 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  29.37 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  32.79 
 
 		 422 aa  196  5.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0333  FolC bifunctional protein  36.47 
 
 		 414 aa  196  9e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0256813  normal  0.0230172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  34.82 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  34.01 
 
 		 817 aa  194  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  34.86 
 
 		 439 aa  193  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.56 
 
 		 470 aa  192  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  31.38 
 
 		 431 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.39 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  35.28 
 
 		 468 aa  192  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.47 
 
 		 431 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  34.35 
 
 		 847 aa  190  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  30.59 
 
 		 427 aa  190  5e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  34.94 
 
 		 437 aa  190  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  34.65 
 
 		 452 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  33.72 
 
 		 435 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  32.27 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  33.72 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  33.87 
 
 		 813 aa  187  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  34.99 
 
 		 463 aa  186  5e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  32.43 
 
 		 878 aa  186  8e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  33.79 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  32.2 
 
 		 451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0673  FolC bifunctional protein  28.31 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.82598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  33.56 
 
 		 440 aa  184  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0591  FolC bifunctional protein  33.61 
 
 		 474 aa  183  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  34.82 
 
 		 426 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  32.64 
 
 		 437 aa  182  8.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2622  FolC bifunctional protein  29.98 
 
 		 413 aa  182  9.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132417  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 		 430 aa  182  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  30.81 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  31.67 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  33.98 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0873  folylpolyglutamate synthetase  32.05 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0218133 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  31.87 
 
 		 543 aa  181  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  33.25 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  29.65 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  31.18 
 
 		 423 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  31.18 
 
 		 423 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  33.33 
 
 		 422 aa  179  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  32.77 
 
 		 438 aa  179  8e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>