36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1771 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1771  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  324  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1829  hypothetical protein  82.47 
 
 
156 aa  229  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0926  hypothetical protein  75.97 
 
 
159 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1117  hypothetical protein  64.24 
 
 
158 aa  163  9e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0589  hypothetical protein  60.96 
 
 
151 aa  153  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0814  hypothetical protein  61.74 
 
 
153 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0466862  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0724  hypothetical protein  60.14 
 
 
156 aa  134  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.47932  normal  0.627224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1560  hypothetical protein  32.88 
 
 
150 aa  90.5  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1238  hypothetical protein  36 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1953  hypothetical protein  32.67 
 
 
155 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3141  hypothetical protein  32.37 
 
 
145 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.820618  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3242  hypothetical protein  32.37 
 
 
145 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613004  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1641  hypothetical protein  30.77 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000251884  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1835  hypothetical protein  30.77 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3043  hypothetical protein  30.94 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0709  hypothetical protein  30.94 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16043e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0698  hypothetical protein  30.94 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0315317  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03832  hypothetical protein  34.04 
 
 
147 aa  67.4  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547406  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1535  hypothetical protein  31.91 
 
 
150 aa  67  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3060  hypothetical protein  28.37 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0250  hypothetical protein  26.62 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.846895  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2378  hypothetical protein  32.58 
 
 
150 aa  62.4  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1659  hypothetical protein  31.16 
 
 
145 aa  62.4  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0865  hypothetical protein  24.46 
 
 
151 aa  61.6  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.580747  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1833  hypothetical protein  29.29 
 
 
149 aa  55.1  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00164737  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0643  hypothetical protein  31.09 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792914  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13471  HAMP domain-containing protein  30.47 
 
 
132 aa  51.2  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1798  hypothetical protein  30.87 
 
 
160 aa  51.2  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.425473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3523  hypothetical protein  23.66 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5116  hypothetical protein  26.24 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4884  hypothetical protein  29.37 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.319335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2835  hypothetical protein  28.8 
 
 
182 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0924305  normal  0.295808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2648  hypothetical protein  33.7 
 
 
151 aa  44.3  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0922458  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0709  hypothetical protein  27.69 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3125  hypothetical protein  25.34 
 
 
161 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.271639  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1026  hypothetical protein  41.51 
 
 
177 aa  41.2  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>