25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1386 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1386  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  98.11 
 
 
89 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  64.71 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  66.67 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  62.75 
 
 
89 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  62 
 
 
90 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2659  hypothetical protein  62 
 
 
85 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0463973  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6036  hypothetical protein  54.72 
 
 
84 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  50.98 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  54.9 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  52.94 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  50.98 
 
 
88 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1409  hypothetical protein  54.55 
 
 
88 aa  61.6  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.209175  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  53.33 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  47.17 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  46.55 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1284  hypothetical protein  49.02 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1402  hypothetical protein  49.02 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  42 
 
 
86 aa  47.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2467  hypothetical protein  38.89 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  65.38 
 
 
401 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  45.45 
 
 
86 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2428  hypothetical protein  44.9 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1901  hypothetical protein  46.51 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0924  hypothetical protein  39.58 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>