13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1320 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1320  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 137 aa  279  1e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.475196  normal  0.327189 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0821  DNA polymerase beta subunit  64.96 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.29047 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0587  DNA polymerase beta subunit  58.59 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.838533 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1502  DNA polymerase beta subunit  49.15 
 
 		 214 aa  120  5e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000371654 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0463  DNA polymerase beta subunit  33.91 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1347  DNA polymerase beta subunit  31.4 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.103374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1089  DNA polymerase beta subunit  35.14 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.947057 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  36.13 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  35.19 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  46.81 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  32.32 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  40.32 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1008  DNA polymerase beta subunit  32.48 
 
 		 281 aa  40.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>