23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0946 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0946  ribosomal protein L29  100 
 
 
115 aa  224  3e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0768  50S ribosomal protein L29P  60 
 
 
73 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0552  50S ribosomal protein L29P  61.67 
 
 
79 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1728  50S ribosomal protein L29P  60 
 
 
77 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0746  50S ribosomal protein L29P  64.71 
 
 
57 aa  67  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0487  ribosomal protein L29  52.73 
 
 
84 aa  56.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1514  ribosomal protein L29  43.75 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.42468e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  43.08 
 
 
83 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0103  50S ribosomal protein L29P  46.88 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  38.71 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0008  50S ribosomal protein L29P  44.07 
 
 
67 aa  42  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000020631  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0295  ribosomal protein L29  39.06 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  38.1 
 
 
65 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2299  50S ribosomal protein L29P  36.07 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  37.88 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  37.31 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  36.51 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  38.71 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  35.82 
 
 
69 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>