46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0577 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0577  putative RNA methylase  100 
 
 
209 aa  425  1e-118  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0475078  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2199  methyltransferase small  43.35 
 
 
204 aa  156  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0236  methyltransferase  42.86 
 
 
202 aa  155  6e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.140784 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0747  methyltransferase small  44.39 
 
 
202 aa  149  4e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1027  methyltransferase small  45.45 
 
 
202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.653498  normal  0.0217295 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2885  Methyltransferase type 11  36.95 
 
 
202 aa  122  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0520  methyltransferase small  37.56 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0651  methyltransferase related protein  31.4 
 
 
201 aa  114  7.999999999999999e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0529  methyltransferase small  35.15 
 
 
211 aa  112  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0731  methyltransferase  34.02 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.557885  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1845  methyltransferase small  36.95 
 
 
203 aa  103  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2169  methyltransferase small  33 
 
 
202 aa  99  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  34 
 
 
209 aa  99  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2486  putative RNA methylase  30.2 
 
 
207 aa  98.2  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1437  methyltransferase  34.76 
 
 
203 aa  96.3  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1492  methyltransferase small  32.2 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0202  methyltransferase small  31.46 
 
 
213 aa  94.7  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0891  methyltransferase  30.23 
 
 
213 aa  94.7  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1709  SAM-binding motif-containing protein  30.23 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1507  methyltransferase small  30.62 
 
 
207 aa  92  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.113673  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  33.5 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2614  methyltransferase small  33.99 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0317  DNA methylase  27.39 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1798  hypothetical protein  29.3 
 
 
219 aa  89.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2083  methyltransferase small  31.31 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1635  methyltransferase  34.22 
 
 
197 aa  89  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89455  predicted protein  35.35 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0270328  hitchhiker  0.00142671 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3583  Methyltransferase type 11  31.96 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  30.26 
 
 
364 aa  53.9  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  27.72 
 
 
367 aa  48.5  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  27.74 
 
 
351 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  28.08 
 
 
350 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.67 
 
 
236 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1622  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  37.65 
 
 
407 aa  42.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.254122 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  45.65 
 
 
389 aa  42.4  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2731  N-6 DNA methylase  32.63 
 
 
626 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  35.71 
 
 
408 aa  42.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1828  hypothetical protein  45.65 
 
 
389 aa  42.4  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.929329  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  43.33 
 
 
173 aa  42.4  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  30.77 
 
 
350 aa  42  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  29.17 
 
 
197 aa  42  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.41 
 
 
202 aa  41.6  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  30.34 
 
 
201 aa  41.6  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  50 
 
 
264 aa  41.6  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  29.09 
 
 
355 aa  41.6  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  50 
 
 
264 aa  41.2  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>