17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2243 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2243  mobile mystery protein A  100 
 
 		 152 aa  309  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1905  XRE family transcriptional regulator  75.66 
 
 		 152 aa  240  5e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.561511 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0742  transcriptional regulator, XRE family  68.42 
 
 		 152 aa  227  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149727  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1390  DNA-binding protein  40.97 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2564  transcriptional regulator, XRE family  43.65 
 
 		 153 aa  98.6  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3298  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3533  transcriptional regulator, XRE family  41.73 
 
 		 176 aa  94  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0001  helix-turn-helix domain containing protein  33.55 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.998773  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0039  mobile mystery protein A  32.89 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1582  mobile mystery protein A  40.94 
 
 		 170 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4246  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000130634 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4942  mobile mystery protein A  35.76 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5363  mobile mystery protein A  43.27 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.084336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0005  mobile mystery protein A  34.25 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0170  DNA-binding protein  36.56 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1697  helix-turn-helix domain-containing protein  38.81 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3013  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>