25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1908 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1908  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  841    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0062  hypothetical protein  27.52 
 
 		 424 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2793  hypothetical protein  31.44 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  28.87 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4505  hypothetical protein  28.03 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1919  hypothetical protein  25.65 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4333  hypothetical protein  27.34 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.989415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1153  hypothetical protein  29.17 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2336  hypothetical protein  27.23 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0189612 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3382  hypothetical protein  27.56 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2955  hypothetical protein  27.27 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4324  hypothetical protein  28.5 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.404094  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3358  hypothetical protein  23.25 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2515  hypothetical protein  22.36 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2654  hypothetical protein  26.77 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113589  normal  0.0183141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0310  hypothetical protein  31.69 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0595  hypothetical protein  26 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28067 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1587  hypothetical protein  37.25 
 
 		 355 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.748272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5038  hypothetical protein  23.53 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0709  hypothetical protein  26.7 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2894  hypothetical protein  25 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0569  hypothetical protein  22.51 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00193  hypothetical protein  28.26 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2702  hypothetical protein  28.24 
 
 		 399 aa  46.6  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3377  hypothetical protein  25.44 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.718952  normal  0.0514733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>